第三个阶段，是反邪恶迫害的阶段。迫害出现的原因，我们知道了，然后就是我们该怎样面对邪恶的迫害了，我们该不该反迫害？这里不仅有个人修炼的问题，还涉及到正法的因素，所以就使整个的问题变的很复杂，在世间体现的形势和人心，也都非常复杂。
迫害开始之后，那真是一段非常灰暗的日子，许多人都经历过。到处都是充斥攻击师父、攻击大法的声音，电台、电视台、报纸、各个地方，到处都是法轮功学员被抓被关的消息。你好我也好、见谁谁乐的美好时光一下子没有了。大法在蒙难。“大法蒙难”，这是师父用的名词。大家知道，其实大法谁也触及不了，旧生命也看不到，真正的法谁也破坏不了，那有人就想，“大法不可能蒙难”。大法本身是不会蒙难的，可是世人和学员在世间对大法的正信，却真的在被践踏，甚至有的人已经没有了正念；我们看到大法在学员和世人身上的体现，真的会被扭曲。而且作为师父、大法和真修弟子，真的在被攻击和污蔑。那这些情况，也真的可以说就是“大法蒙难”。“大法蒙难”其实是世人和学员对大法正念的蒙难。这个阶段对坚信师父大法的学员来说，真是一段灰暗的日子。身在其中的人，都一下子都遭到了调查，有的甚至直接被抓。在这个阶段，许多学员或早或晚都开始上北京，或者不断去给自己周围的人讲真相，向各级部门去反映，到最后甚至进监狱、学习班，有些甚至遭到严重的人身摧残。对大家来说，这是心情非常沉重难过的一段经历。
我们有一条线索是和《转法轮》对应的。前面讲蜜月期认识法的第一个阶段，是对应在《转法轮》第四讲“业力的转化”、“提高心性”那儿，这些都是讲做好人好事，大家修的都挺高兴。我们再按《转法轮》这一段接着往后看，第四讲最后就是“玄关设位”。“玄关设位”里边有什么东西呢？里边提到玄关，说玄关到眼睛这个位置上时，那天目的结构象北京天安门一样，书里说：“因为我们身体的百脉从这里交汇，那么这时百脉都得经过玄关绕一圈出去，都要走玄关”，都要绕“玄关”一圈，而玄关这时就在象天安门的天目那里。什么意思呀？其实就是说都要绕“天安门”一圈。书里接着说“然后形成这套东西之后，个把月它就开始回去了。”回来以后又怎么样呢？大家看书上怎么写的？玄关设位最后一次再出来的时候，它又是象层层铁门一样。所以很多学员也想了，这个“玄关设位”里面绕“天安门”一圈，跟我们上北京上访去天安门溜一圈是不是很像啊！第一次上北京完了以后，个把月都回来了。因为一般来说第一次去北京，就是行政拘留半个月、一个月的，那时候真是个把月都回来了，当然有些人直接给关了很久，但总体上来讲是个把月回来了，很多人都是这样的。那么到最后很多学员也进了监狱，监狱里面什么样？还是和“玄关设位”中讲的一样，都是层层的铁门。所以整个形式，我们走过的路，和《转法轮》那真的对应得一模一样的。
我们在《转法轮》中看到这些形式以后，也有人就说，“你看法里面这么定下来了，咱们就是得这么做”。所以他又认可这些迫害了。表面形式的确是这样的，那这个意思当然是否定不了的。但咱们回过头来看，是不是你这样做了，那你就肯定是对的？这个就不好说了，咱们还得看真正的人心，是不是？不能说我们把“去一趟北京”作为衡量标准了。衡量标准不会有第二个的。当然去不去北京，也是形式上的，可他也的确是和修炼有关联的。你要是没有去北京，在那个环境下，除非你心里能达到这个标准，那也是很难的，但总有情况特殊的。说去北京的学员，总体来说当时是好的，是维护大法去了，大多数是达到那个标准了。这是我们讲的这段灰暗的日子，当时发生的一些事情。怎么去看上北京这些事情？其实这些事情我们前面已经讲了很多了，就是迫害发生了，我们必须去反迫害，但是仅仅反迫害本身还是不够的，反迫害本身、上北京等等都是形式，我们还要在其中证实法才行。
